ФНС России в письме от 20.10.2025 № СД-4-3/9400@ разъяснила, что организация при утрате в течение 2024 года права на применение нулевой ставки по налогу на прибыль как участник проекта «Сколково» не вправе с первого дня налогового периода 2024 года применять ставку 0% для организаций, осуществляющих деятельность в области информационных технологий.
Налоговая служба напомнила, что п. 5.1 ст. 284 НК РФ для участников проекта «Сколково» установлен специальный порядок налогообложения прибыли в периоде, когда организация утрачивает право на применение нулевой ставки. В частности, таким обстоятельством является получение прибыли с начала налогового периода в размере, превышающем 300 млн руб. В этом случае полученная участником проекта «Сколково» прибыль подлежит налогообложению по налоговой ставке, установленной п. 1 ст. 284 НК РФ (20% до 01.01.2025), с начислением пеней за несвоевременную уплату налога на прибыль организаций и авансовых платежей по нему. Аналогичная позиция выражена в письмах Минфина России от 20.06.2023 № 03-03-06/1/56962, от 12.08.2025 № 03-03-06/1/78068.
